No resulta difícil identificar la figura de Jonás con Cristo, ya que el propio Señor señaló la similitud entre la estancia del profeta durante tres días y tres noches sepultado en el vientre del gran pez y su propia muerte y sepultura en el corazón de la tierra. Al mismo tiempo, no deberíamos pensar que al margen de aquella experiencia Jonás era un tipo despreciable, como muchos se han apresurado a sentenciar. Muy al contrario, los rasgos cristológicos son claros y evidentes.

El autor, fiel a la tradición de los narradores bíblicos, no descubre el motivo de la huida de Jonás, ni explica por qué se negó a viajar a la capital asiria en obediencia al Señor. Muchos comentaristas se han precipitado a llenar la laguna en el texto y suplir, sin dudarlo, la causa de su decisión, tildándole de cobarde, xenófobo y rebelde. De lo relatado hasta aquí, sin embargo, se pone de manifiesto la nobleza de su carácter: Jonás es un hombre veraz, valiente y compasivo. Llama la atención la integridad de su confesión de fe en Jehová no menos que su firme voluntad de poner su propia vida en rescate de los marineros paganos que luchaban por salvar el navío. Lo que sucede a continuación consagra a Jonás como uno de los más grandes héroes de la historia bíblica, el único profeta con el que Cristo se identificó de manera explícita, y pone en tela de juicio la actitud despectiva de muchos. Jonás mismo desvela las claves de aquella experiencia, en una plegaria elevada a Dios desde el fondo del mar (cap. 2):

Entonces oró Jonás a Jehová su Dios desde el vientre del pez, y dijo:
Mas tú sacaste mi vida de la sepultura, oh Jehová Dios mío.
Cuando mi alma desfallecía en mí, me acordé de Jehová,
Pagaré lo que prometí.
La salvación es de Jehová.

La oración de Jonás es mesiánica, afín a otras plegarias que forman parte de la historia bíblica, como la de Ana (1 S. 2:1, 6), o David en muchos de sus salmos. Uno de ellos, el Sal. 69, que guarda una similitud exacta con la oración de Jonás, fue recordado por Cristo en la Cruz (Jn. 19:28-29).

No termina ahí la similitud de Jonás con Cristo. Jonás, el «profeta desobediente», recibe de nuevo su comisión por parte del Señor para proclamar un mensaje de arrepentimiento en Nínive (3:1-3). Resulta claro que el Señor quería que Jonás, y no otro, fuese a Nínive como enviado suyo, y el profeta fue, en obediencia, como un verdadero apóstol a los gentiles, para cumplir una misión sin precedentes en la historia de la Salvación.

¿En qué consiste el valor cristológico de la experiencia de Jonás, al margen de las similitudes o paralelismos que presenta su historia? Consiste en permitirnos vislumbrar la lucha de Jesús, uno «mayor que Jonás» (Mt. 12:41), ya que a través del testimonio de Jonás podemos entrever lo que costó al Hijo de Dios cumplir la voluntad de Dios, sin volver atrás. Pero queda aún el episodio más asombroso de todos, como veremos a continuación.